El Lotus Exige Sport 350 también está disponible con cambio automático de seis velocidades, con el que los conductores pueden cambiar de marcha manualmente mediante unas levas de aluminio forjado situadas detrás del volante, o dejar que la caja de cambios funcione en modo automático.
El panel de control del cambio automático está perfectamente integrado en la consola central de la cabina, con botones para el aparcar, marcha atras, punto muerto y marcha. Las subidas de marcha se hacen en sólo 240 milisegundos, mientras que las reducciones de marcha van acompañadas de una pequeña aceleración automática (cuando estamos en el modo Sport).
Cuando el Exige está equipado con la caja de cambios automática opcional, el nuevo Exige Sport 350 algo más rápido ya que recorre los primeros 100 km en solo 3,8 segundos, mientras que tarda 3,9 segundos con la caja de cambios manual. La diferencia de tiempo es debida a la caja de cambios optimizada electrónicamente.